Préchauffez le four à 190 degrés. Pelez le céleri-rave à l'aide d'un couteau plutôt que d'un économe ; la peau est épaisse et fibreuse et doit être entièrement retirée. Coupez-le en dés d'un centimètre.
Faites chauffer deux cuillères à soupe d'huile d'olive dans une poêle allant au four d'environ vingt centimètres et faites-y revenir les dés de céleri-rave pendant huit à dix minutes à feu moyen jusqu'à ce qu'ils soient dorés et tendres. Ajoutez l'oignon coupé en demi-rondelles et poursuivez la cuisson pendant cinq minutes jusqu'à ce qu'il soit tendre. Assaisonnez de sel, de poivre et de noix de muscade.
Fouettez les œufs avec la crème, une pincée de sel et du poivre noir, puis incorporez la moitié du fromage râpé. La crème augmente la teneur en matières grasses et ralentit la coagulation, ce qui permet à la frittata de rester moelleuse plutôt que de devenir caoutchouteuse.
Versez le mélange d'œufs sur les légumes dans la poêle, secouez légèrement pour bien répartir le tout et laissez cuire le fond pendant deux minutes à feu doux. Saupoudrez avec le reste du fromage et parsemez de feuilles de thym.
Enfournez la poêle pendant quinze à dix-huit minutes, jusqu'à ce que la frittata soit encore légèrement souple au centre sous la pression du doigt. La cuire jusqu'à ce qu'elle soit complètement ferme serait une erreur, car la chaleur résiduelle continue de la cuire après sa sortie du four.
Laissez reposer pendant de cinq minutes, coupez en parts et servez accompagné de mâche et de ciboulette.